O jogo se afasta mais de seus antecessores tanto na história quanto na apresentação. Agora, os heróis são membros de um clã ninja que precisam derrotar um imperador maligno antes que ele seja libertado. Pela primeira vez, o jogador pode escolher qual personagem usar, e cada um deles tem pontos fortes e fracos próprios. Depois de um certo capítulo, dois chefes que enfrentam o jogador também se tornam jogáveis, permitindo trocar de personagem se desejar.
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| Plataforma | Data | Região |
|---|---|---|
| Neo Geo MVS | 17/01/2001 | América do Norte |
| Neo Geo AES | 24/01/2001 | América do Norte |
| Arcade | 04/11/2001 | Mundial |
| Wii | 08/04/2013 | Japão |
| Wii | 05/06/2013 | América do Norte |
| Wii | 04/09/2013 | Europa |
| Linux | 07/12/2015 | Mundial |
| Mac | 07/12/2015 | Mundial |
| PC (Microsoft Windows) | 07/12/2015 | Mundial |