Uma máquina do tempo criada por acidente pode desencadear a Terceira Guerra Mundial. Antes que a maior parte da população seja morta, as duas pessoas mais próximas de Rintaro podem estar prestes a morrer. Quando Rintaro e Mayuri vão a uma conferência, eles encontram o corpo de Kurisu. Alarmado, Rintaro envia uma mensagem para um amigo. O que ele não sabe é que essa mensagem chega ao passado e altera a linha do tempo. Nessa nova realidade, Kurisu está viva e conta a ele sobre um grupo chamado SERN. A organização fará de tudo para assumir o controle da máquina do tempo. Para detê-la, Rintaro precisa voltar no tempo repetidas vezes e mentir para muita gente.
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| Plataforma | Data | Região |
|---|---|---|
| Xbox 360 | 15/06/2011 | Japão |
| PlayStation 3 | 23/05/2012 | Japão |
| PlayStation Vita | 13/03/2013 | Japão |