Sailor Moon S é a terceira temporada original do anime, que envolve os principais antagonistas, os Death Busters e a misteriosa Sailor Uranus e Sailor Neptune que buscam cristais puros do coração que seguram os três talismãs místicos que são as chaves para o poderoso Santo Graal .Na segunda metade da série, os Death Busters começam a coletar cristais puros do coração, a fim de despertar o Messias mortal do Silêncio e trazer a destruição e obliteração sobre o mundo. A décima Sailor Senshi e última do Milênio de Prata, Sailor Saturn, é introduzida. Esta temporada é seguido por Sailor Moon S: O Filme-Corações em Gelo e depois a quarta temporada.
Após ter visões apocalípticas, Rei é atacada por um monstro extremamente poderoso que Sailor Moon não consegue derrotar.
Uma jovem é atacada por um Daimon, mas Usagi não consegue mais se transformar em Sailor Moon, e a poderosa Sailor Team precisa contar novamente com suas novas guardiãs.
Usagi e Minako ficam encantadas por Haruka Tenou, um rapaz atraente e sofisticado... ou pelo menos é o que elas pensam.
Preocupada por não ser inteligente o suficiente para o sofisticado Mamoru, Usagi pede conselhos a Michiru.
A amiga de Usagi, Unazuki, é atacada por um Daimon e perde seu Cristal do Coração Puro. Após o cristal cair, Sailor Moon precisa correr para encontrá-lo e salvar Unazuki.
Naru e Umino participam de uma Competição de Afeto para provar o amor que sentem um pelo outro, mas acabam sendo alvo de um Daimon.
Makoto é alvo de um Daimon, mas consegue escapar. Haruka se torna amiga de Makoto para se aproximar dela e de seu cristal de coração puro.
O desejo de Ami de evitar a competição a leva a ofender Michiru durante uma corrida de natação. Enquanto isso, um Daimon escolhe Ami como seu alvo.
Após Sailor Netuno ser capturada e possivelmente morta por Kaolinite, Sailor Moon e Sailor Urano se veem acorrentadas juntas e são forçadas a reavaliar suas atitudes em relação a cada torre.
Preocupado com a meditação cada vez mais intensa de Rei, Yuuichirou começa a temer que ela esteja apaixonada por outro homem. Ao vê-la com Haruka, ele se convence de que ela é a nova pretendente de Rei.
Minako fica desanimada com sua vida como Sailor Vênus. Enquanto isso, uma antiga amiga dela é atacada por Daimon.
Usagi está brava com Mamoru por ele não saber que é seu aniversário, mas se sente culpada porque percebe que nunca lhe contou a data. De presente de aniversário, Mamoru lhe dá seus sapatos de cristal, mas o ovo do Daimon Coração está dentro.
O cristal do coração da Sailor Moon quase foi roubado. Netuno e Urano o restauram, e as guerreiras descobrem que são Michiru e Haruka. Uma batalha com Kaori a faz cair e morrer.
Chibiusa chega à cidade durante um festival, onde todas as guerreiras estão trabalhando. Uma cantora se torna alvo de Eugeal e é atacada... e todas as guerreiras, incluindo Chibiusa como Chibimoon, lutam para salvar seu coração.
A solitária Chibiusa procura amigos, e quando encontra um... ele se torna um alvo, então eles precisam ajudá-la a salvar seu coração.
Makoto perde uma luta e decide ir para um local de treinamento com um dos treinadores mais inteligentes e corajosos de todos os tempos, e as garotas o seguem. O mestre acaba sendo um alvo, e elas precisam salvar seu coração o mais rápido possível, mas Jupiter está especialmente empenhada na missão.
Haruka relembra os velhos tempos, enquanto Usagi e as outras garotas exploram o futuro colégio, onde encontram Elsa Gray, uma antiga amiga de corrida de Haruka... que se torna um alvo. Urano e Netuno, junto com as outras garotas, lutam para salvar o coração dela do demônio, e como o coração não é puro, ele é restaurado.
Chibiusa se apaixona por Masanori, o jovem escultor de sua aula de arte. No entanto, Masanori parece mais interessado em Michiru.
Usagi e suas amigas são convidadas para uma festa de estudantes universitários estrangeiros, mas seu entusiasmo é atenuado pela consciência de que a maior parte da conversa será em inglês.
Minako percebe que é a única da Equipe Sailor que não foi alvo por causa de seu Cristal do Coração Puro e toma medidas cada vez mais absurdas para provar sua pureza.
Chegou a hora! Eugeal quer uma luta com Netuno e Urano, e eles estão dispostos a sacrificar um ao outro para obter os talismãs. Mas então descobrem que eles, e Plutão, possuem os talismãs: o Espelho de Netuno, a Espada de Urano e o Orbe de Granada de Plutão.
Sailor Plutão aparece e desperta Sailor Urano e Sailor Netuno, e os três talismãs entram em ressonância (o terceiro sendo o Orbe de Granada de Plutão). O Santo Graal aparece e Sailor Moon expulsa Eudial. Mimete mata Eudial sabotando seu carro.
Chibiusa encontra Hotaru Tomoe, que tem um lado bastante sombrio.
Usagi descobre que Kaori está viva e se passando por empregada de Tomoe. Será que Hotaru tem alguma ligação com o messias?
Mimet é fã de ídolos. Isso afetará suas habilidades como Death Buster?
Hotaru se esforça demais e é levada para o hospital, enquanto Mimete mira em um ator de televisão para obter seu Cristal do Coração Puro.
Chibiusa convida Hotaru para um piquenique em um jardim botânico local, sem perceber que o botânico residente é o próximo alvo dos Death Busters.
Através da história de Mamoru, todos começam a aprender mais sobre as Sailor Guardiãs do Exterior.
Quando Mimete decide ajudar na produção de um Daimon, ela acidentalmente cria uma anomalia que fratura as dimensões dentro da residência Tomoe, prendendo Chibiusa e Hotaru.
Chibiusa convida Hotaru para um show no planetário, enquanto Mimete planeja roubar o Cristal do Coração Puro do DJ Thomas Harris.
Após Hotaru e seu pai desaparecerem de casa, as Sailor Senshi se infiltram na Academia Mugen, suspeitando que ela esteja ligada aos Death Busters.
Tellu abre uma loja que vende Telluns, plantas criadas para remover Cristais do Coração Puro. Enquanto isso, Hotaru acorda, confusa, na câmara do Messias do Silêncio.
Com a realização da mais recente rodada de exames nacionais Patrice na Academia Mugen, a Equipe Sailor se infiltra na escola e Ami encontra sua rival acadêmica, Yui Bidou.
Cyprine, a última das Witches 5, convoca os alunos da Academia Mugen para remover seu Cristal do Coração Puro, enquanto Kaolinite tem Chibiusa como alvo.
As Sailor Guardiãs chegam à Academia Mugen para salvar Chibiusa e derrotar os Death Busters, enquanto a Mistress 9 planeja roubar o Santo Graal da Sailor Moon.
A Mistress 9 roubou o Santo Graal, permitindo que o Pharaoh 90 atravessasse o portal para a Terra. O destino do mundo está relacionado nas mãos da guardiã da ruína, Sailor Saturno.
Os Death Busters foram derrotados, mas Hotaru está reduzida à infância e o paradeiro de Sailor Plutão ainda é desconhecido. Enquanto isso, Haruka e Michiru têm uma última missão antes de deixarem Azabu-Juban.
Um último Daimon emerge dos escombros da Academia Mugen e começa a roubar corações puros. Chibiusa parte para o futuro e retorna a tempo de ajudar a destruir o Daimon.
Esta temporada ainda não possui avaliações da crítica.
Esta temporada ainda não possui avaliações do público.