Um dia, um vírus misterioso apareceu na Terra, que matou todos os humanos infectados com idade superior a 13 anos. Ao mesmo tempo, os vampiros surgiram a partir de trevas do mundo e da humanidade escravizada. Hyakuya Yuuichirou, um jovem rapaz, que, juntamente com o resto das crianças de seu orfanato, são tratados como gado pelos vampiros. Mesmo em cativeiro, Yuuichirou sonha grande. Ele sonha em matar vampiros. Ele sonha em matar todos eles.
Shinoa treina com Guren antes de visitar Yu na biblioteca. Ela lhe conta sobre a transformação de humanos em vampiros. Em seguida, Kureto Hiragi convoca Yu para interrogá-lo sobre um espião vampiro, enquanto tortura Kimizuki e Yoichi para fazê-lo revelar a verdade. Depois, Yu questiona Guren sobre o assunto e pergunta se Mika também lhe seria útil. Em Sanguinem, Mika sofre de fome e Ferid recomenda interromper seu crescimento ali. Uma criança oferece seu sangue a Ferid, que tenta Mika a bebê-lo, mas Mika recusa. Ferid então convida Mika para a reunião do Conselho dos Progenitores.
Yoichi elimina cinco cavaleiros com um único ataque, e Yu inicia a próxima etapa de seu treinamento. Yu luta contra Asuramaru em sua mente e o derrota ao pedir para serem amigos. Na reunião do Conselho Progenitor, Ferid discute a batalha em Shinjuku e Mika apresenta um vídeo mostrando a transformação de Yu. Krul ataca Ferid, mas erra o golpe intencionalmente. Ferid explica que ela não pode matá-lo. Kimizuki luta contra Kiseki-o e enfrenta memórias onde lhe foi ordenado matar sua irmã. Ele se liberta e sai vitorioso ao se lembrar dos sentimentos de Yu por Mika, que são como família, mesmo sem laços de sangue. Kimizuki e Yu exibem suas novas técnicas, e Shinoa e Mitsuba descobrem que os arquivos dos três garotos foram apagados.
A criança que contatou Ferid Bathory no episódio anterior envia uma carta por pombo-correio para Aoi Sangu, que a repassa para Kureto. O Esquadrão Shinoa se reúne, e Kureto Hiragi e Guren Ichinose fazem o mesmo. Kureto anuncia seu plano de atacar e eliminar dez vampiros nobres em Nagoya antes que os vampiros lancem seu exército principal sobre o Japão em um mês. Shinoa revela que Yu tentou matá-la durante a batalha em Shinjuku, e o esquadrão pondera se deve ou não continuar seguindo Guren. Eventualmente, eles decidem segui-lo e estabelecem como política proteger sua família. Enquanto isso, Mika ataca Krul para obter seu sangue. Assim que ele se acalma, ela revela seus planos e lhe dá uma missão secreta. Shinoa informa Guren sobre o sucesso do treinamento de seu esquadrão, e ele lhe dá novas ordens. Mika se encontra com outros vampiros para irem a Nagoya, e Kureto ordena experimentos potencialmente letais em Mirai Kimizuki.
Quando o esquadrão Shinoa chega atrasado, eles percebem a seriedade da missão para Guren. Sabendo que se trata de uma missão impossível, onde muitos morrerão, Guren deixa suas emoções de lado e ordena a seus homens que não se limitem a sobreviver, mas sim a vencer.
Os esquadrões Shinoa e Narumi unem forças para cumprir sua missão: matar o Décimo Quinto Progenitor, Lucal Wesker. Enquanto eles são bem-sucedidos em sua missão sem perder ninguém, outros não tiveram a mesma sorte. Nove equipes falham e são feitas reféns...
O esquadrão Shinoa reaprende a dura realidade de que é muito possível perder companheiros, mas não há tempo para lamentações. Eles precisam seguir em frente para resgatar os reféns. Logo após a partida deles, Mika e os outros vampiros também chegam a Nagoya.
Os esquadrões de Guren, Shinoa e Narumi chegam à prefeitura e veem os reféns. Sabendo que é uma armadilha, eles ainda decidem ir resgatá-los, mas Guren e Shinya se veem em apuros com Crowley, tendo dificuldades até mesmo para fugir dele.
O esquadrão de Shinoa vai resgatar Guren, mas, infelizmente, o tempo acaba. Relutantemente, eles o deixam para trás e recuam, mas Yu simplesmente não consegue fazer o mesmo. Em vez disso, ele toma mais Pílulas Estimulantes da Maldição para ir salvar Guren pessoalmente.
Graças à sua "experimentação", Yu se recupera milagrosamente e, mais uma vez, volta para salvar Guren. Forçando-se demais, Yu quase se transforma em um demônio, mas Kimizuki o impede à força. O esquadrão carrega Yu para fora e segue para um lugar seguro, mas então encontra Mika.
Yu e Mika finalmente se reencontram, mas os ferimentos que Mika sofreu lutando contra a Companhia Demoníaca ameaçam sua vida. Determinado a manter Mika vivo, Yu tenta convencê-lo a beber seu sangue... mesmo que isso signifique que Mika se tornará um vampiro de verdade.
Os sobreviventes da Companhia Demônio da Lua chegam ao ponto de encontro, apenas para descobrir que suas ordens são "ficar de prontidão". Enfurecidos, eles decidem ignorar as ordens para salvar Guren, quando Kureto aparece. Aparentemente, Kureto tem outros planos.
A carta na manga de Kureto era Mirai, a irmã mais nova de Kimizuki e outra cobaia dos Serafins do Fim. Para deter o Exército Demoníaco Imperial Japonês, Yu não tem escolha a não ser recorrer à sua "trombeta" interior para acessar os poderes do anjo.
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