Nossa história se passa 1300 anos após os eventos de Como Treinar o Seu Dragão: O Mundo Escondido, no mundo moderno dos dias atuais, onde a existência de dragões é tratada como fantasia, mito e lenda.
Quando Phil ameaça fechar o novo hospital do dragão de De Ângelo e banir os dragões da ICARIS, De Ângelo e um pequeno Papatudo precisam fazê-lo mudar de ideia.
Enquanto Tom sofre para admitir seus sentimentos pela Jun, os dois acabam se vendo presos dentro de uma árvore gigante com uma nervosa colônia de Dragão Marmota.
Trovão precisa controlar e liderar os Dragões Heróis em uma tentativa desesperada de salvar Tom e os outros treinadores de um novo e perigoso dragão, o Dragão Forja Vidro
Quando Jun joga tarô, as cartas revelam que os treinadores vão se separar! Para desafiar tal destino, Jun força o grupo a permanecer junto enquanto procuram por um dragão que conseguiu furar a barreira de enguias da Cidade Rakke.
Com a separação do treinadores de dragões, Eugênio tentar fazer o seu próprio Clube do Dragão.
Quando Trovão estraga acidentalment o tablet de Alê, ela sai sozinha e é capturada pelo Serra Elétrica.
Tom e os treinadores precisam finalmente superar suas diferenças e se juntar como uma equipe para sobreviver ao Reino da Escuridão.
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